元代宫廷饮膳太医、蒙古族营养学家忽思慧编撰的《饮膳正要》是中国古代一部饮食卫生与营养学专著，记载了大量的蒙古饮食为主的饮食疗法内容。如《饮膳正要》中论及酸马奶时说：“马乳，性冷，味甘，止渴，治热。”认为酸马奶酒性轻而温，味道甘中有酸，微涩。具有增强胃火、帮助消化、调理体质、柔软皮肤、活血化瘀、改善睡眠、解毒、补血等功能。蒙医饮食疗法不仅提出了饮食治疗原则，而且将其拓展和贯穿于疾病的预防、诊断、治疗和康复的各个阶段，成为我国少数民族传统医药宝库中的一朵奇葩。在此时期，蒙医骨科和外伤治疗等也飞速发展且一枝独秀，发展了多种行之有效的治疗方法，如蒙医正骨术，看似方法简陋，但临床治疗效果却好得惊人，其他治疗方法还有震脑疗法、按摩疗法、罨敷疗法等。这一时期的蒙医饮食疗法、蒙医骨科和外伤治疗等医疗经验的积累，为后来蒙医药学自成体系奠定了深厚的基础。