苗药是在苗医药基础理论指导下发展起来的。由于受没有文字的限制，苗族医药理论总结和发展相对缓慢，系统性相对不足。但是对疾病治疗经验的积累却从未停歇过，这些经验往往通过家传、师传、交流或歌谣等形式传承下来。苗医药基础理论主要包括苗医药基本观念、苗医生成学、苗医生理观、病因和病理观等。

　　苗医药基本观念，主要有人天合一的自然观和万物有灵观。

　　人天合一的自然观认为：人处于天地之间，各种自然现象及周围事物无不与人类的生产、生活和健康息息相关。人类要保持健康状态，必须了解和掌握这些自然现象和自然规律。自然条件是不断变化的，人类应该适应这些变化，趋利避害，与自然和谐相处。保持这种和谐状态是人类生存和健康的基础，一旦这种和谐遭到破坏，就会产生疾病。人天合一的自然观是苗族养身保健的基本理念，苗族医药学既重视人体内部小环境的协调，又注重人体与外部大环境的融合，根据就是人天合一思想。如苗医毒学说强调“适度为养，过度为毒”，这种病因观正是源于人天合一的自然观。

　　万物有灵观念有两个方面含义：其一是当看到某些非人类具有的特殊的自然力量时，往往会认为自己也能唤起和创造出这种特殊力量，如“呼风唤雨”、“腾云驾雾”、“长生不老”等，在医药上的反映见于各种习俗和咒语；其二是常常把人类具有的能力赋予万事万物，把人类自身的生命力嫁接到其他自然物上，日月星辰、花虫鸟兽、金木水火都有思想和灵魂。这种万物有灵观念对苗族医药学有广泛影响，治疗方法中的“相克为治”原则，用药方法中“以形解形”、“以脏治脏”均源于此种观念。

　　苗医生成学是由已故湖南著名苗医龙玉六口传，经当地学者整理《事物生成共源根》中叙述的苗族古代哲学，是苗族对事物的产生、形成和发展的认识论，反映了苗族对事物认识的独特眼光和思维方式。把这种观点运用于医学就形成了苗族医学的哲学内容之一——苗医生成学。苗医生成学的主要内容包括事物生成的三大基本要素、事物生成的三大辩证观点、事物生成的三大关系和事物生成的三大结局。三大基本要素包括能量（搜媚苦）、物质（各薄港搜）、结构（玛汝务翠）。事物生成的三大辩证观点包括三本一体观、事物演进观、破坏均衡观。事物生成的三大关系包括生成相资、生成相制、生成相取。事物生成的三大结局包括生成胜负、生成难全、生成增多变好。苗医生成学湘西苗医尚三学派的指导思想，它可以认识人体的生命现象、说明生命功能、寻找致病原因、提供诊断依据、分析药物的作用、指导临床实践。

　　苗医生理观包括三生成学说、五基成物学说、人体构成的基本组份、三界学说、九驾组学说、交环学说、三肚学说、气血水三要素论、四大筋脉学说、六大关节学说、魂魄学说等。三生成学说认为万事万物的生成都源于能量、物质、结构三大要素。五基成物学说认为能量、物质、结构三大要素处于不断变化中，有形变和质变，但归根结蒂，最基本物质只有光、气、水、土、石五种，这就是五基成物。人体构成的基本组份有气、血、水、骨、髓、肉、筋、皮、毛等。三界学说把人体分为树界、土界和水界三个主要功能区域，树界是人体最重要的功能区，大脑和十窟中的七窟位于树界，树界是生灵的象征，人体的总指挥部。土界象征生命的土壤，是树生长的始基，土界中的脏器最多，心、肝、肺、脾、胃、肠都在此。水界是生命之源，主要包含肾架和性架，负责全身水液输布和排泄，产生男精女液。三界协调，动态平衡才能发挥出正常生理功能。九驾组学说把人体分为九个架组：脑架、身架、窟架、肾架、心架、肺架、肝架、性架和肚架。架组是根据功能划分的，与具体器官不完全对应，是苗医对人体结构的独特划分方法。交环学说认为人体内存在上、下两个交环，但都不是实质器官，而是来自脑髓的筋丝组成的综合功能群体。上交环在咽喉周围，处于口腔、鼻腔与气管、食管交界处；下交环在大小肠交接处周围，在肚脐的水平部位形成一个宽带的环。上下两个交环是人体上下部各器官的两大管理机构，两者合套就能协调，维持正常的生理活动。三肚学说讲的三肚包括大肚（各气旮）、手肚（各气兜）、脚肚（各气糯）。大肚即人体腹部，手肚即前臂肌肉丰盛部，脚肚限于小腿肌肉丰盛部。大肚为营养之仓，气力之源；手肚为上身力气所注之处，是活动之基，臂力之源；腿肚下半身力量所注之处，下肢活动之根本。三肚均为力气之征，三肚协调互补，身强力壮。气血水三要素论认为气、血、水是构成人体最重要的物质基础，人的生、老、病、死与它们关系密切。四大筋脉学说认为，筋脉是两个关系密切的重要的生理系统，常合称为筋脉。人体筋脉有干流与支流之别，如纵横的水系分布全身，形成严密的网络，是气、血输布全身的两个系统。筋，发源于脑，主行于脊，分布四肢和全身，主要功能是传导和执行大脑发出的指挥、联系和牵动每一块肌肉和骨骼。脉，发之于心，行于内脏，分布四肢。主要功能是向四肢、各脏器、大脑、全身各组织输送血液、精微和水分，是人体的补给线。筋脉的特点是“以通为用，以畅为安，以塞为病，以绝而亡。”六大关节学说认为，人体的肩关节、肘关节、腕关节、髂关节、膝关节和踝关节，是“运动的节点，旋转的枢纽，屈伸之精要，筋脉之要冲”。六大关节担负重要功能，也是易于受损害的薄弱环节。魂魄学说认为，人体分为精神与物质两个部分。物质是看得见、摸得着的具体客观存在。精神则是看不见、摸不着的人的意识、意志和智慧。后者就是巫学讲的魂魄，巫学认为，人的魂魄源于先天，而躯体源于后天，两不相干。魂魄与躯体共存，但人的死亡是躯体死亡，魂魄不会死亡。正常状态下，魂安魄定，则情绪良好，谈笑自若，神志清醒，精神饱满；魂离魄乱，则魂不守舍，情绪低落，神志不清，昏迷不醒。

参考资料：中央民族大学民族药课题组编《民族药》，中国经济出版社2013版